MIL OSI Перевод. Анализ вечернего отчета – с английского на русский –
Источник: The Conversation (Австралия и Новая Зеландия). – Джемма Геохеган, старший преподаватель и младший научный сотрудник ESR, Университет Отаго.
ГеттиИзображения
Новый гибридный вариант COVID-19, получивший название XE, вызвал новые опасения недавно.
XE представляет собой комбинацию высококонтагиозных вариантов BA.1 и BA.2 Omicron и был первым обнаружен в Великобритании в середине января. Его шиповидный белок происходит от BA.2, что потенциально является хорошей новостью для Новой Зеландии, поскольку это доминирующий вариант (более 90% недавних инфекций), и люди, которые были инфицированы, должны иметь некоторую защиту от XE.
На сегодняшний день во всем мире около 700 вирусных геномов были присвоены XE. Этот вариант в основном был обнаружен в Великобритании, а теперь в нескольких случаях в других местах, включая Таиланд и США, скорее всего, из-за распространения, связанного с поездками.
Согласно текущим оценки из Великобритании, XE имеет небольшое (5-10%) преимущество в передаче по сравнению с BA.2, что делает его наиболее передающимся подвариантом Omicron, идентифицированным на сегодняшний день. Каждый раз, когда появляется новый, более заразный вариант, у него есть шанс со временем стать доминирующим вариантом.
XE еще не присвоена собственная греческая буква. На данный момент он принадлежит Omicron, пока не будут выявлены существенные различия в характеристиках передачи и заболевания, включая тяжесть.
До сих пор недостаточно доказательств, чтобы сделать твердые выводы о трансмиссивности XE, и почти нет данных о его тяжести или способности уклоняться от иммунитета.
Как появляются гибридные варианты
Обычно каждый отдельный вирус является почти точной копией своего единственного родительского вируса. Но вирусы также подвергаются процессу, называемому рекомбинацией, — у них могут быть два родителя.
Рекомбинантные вирусы могут возникать, когда два или более вариантов инфицируют одну и ту же клетку у человека, что позволяет вариантам взаимодействовать во время репликации. Это может привести к смешению их генетического материала с образованием новых комбинаций вирусов.
Некоторые вирусы, такие как грипп, имеют сегментированные геномы и могут смешивать целые сегменты посредством процесс, называемый реассортацией. Вирусная рекомбинация и рекомбинация распространены среди вирусов, но скорость заметно различается в зависимости от типа вируса и вероятности коинфекции.
После более чем двух лет пандемии и высоких показателей инфицирования во всем мире рекомбинация SARS-CoV-2 более вероятна и легче обнаруживается, чем на более ранних стадиях. Глобальная волна Omicron привела к быстрому увеличению распространенности COVID, что увеличивает вероятность коинфекции и дает вирусу больше шансов на рекомбинацию.
Прочитайте больше:Что такое новый вариант COVID-19 BA.2 и вызовет ли он новую волну инфекций в США?
Мы также в большей степени способны обнаруживать рекомбинацию, чем раньше. В начале пандемии в вирусе SARS-CoV-2 было мало генетического разнообразия, а рекомбинанты выглядели очень похоже на нерекомбинанты, потому что два родительских вируса были почти идентичны.
Но теперь есть несколько различных геномных вариантов, заражающих людей в одной и той же области, что значительно упрощает обнаружение рекомбинантных геномов среди миллионов геномов, созданных на сегодняшний день. Вирусная рекомбинация, вероятно, будет играть важную роль в продолжающейся эволюции SARS-CoV-2.
Известные вирусные рекомбинанты
Недавно было идентифицировано несколько рекомбинантных вариантов SARS-CoV-2, названных XA, XB, XC и т. д., вплоть до XS. Некоторые из этих вариантов были секвенированы еще в середине 2020 года. Некоторых видели всего несколько раз, в то время как другим приписано несколько сотен геномов.
В настоящее время часто обнаруживаются два основных типа рекомбинантов: смеси дельта и омикрон (получившие название дельтакрон) и смеси подвариантов омикрон.
Прочитайте больше:Дельтакрон: что ученые знают об этом новом гибридном коронавирусе
За некоторыми из этих рекомбинантов внимательно следят. К ним относятся XD и XF, состоящие из генетического материала Delta и подварианта BA.1 Omicron.
XD был впервые обнаружен во Франции и содержит смесь шиповидного белка из BA.1 и остальной части генома из Delta. Были некоторые опасения, что он унаследует способность BA.1 обходить нашу иммунную защиту и высокую вирулентность Delta. На сегодняшний день XD не распространяется широко или быстро.
Должны ли мы быть обеспокоены?
Пока нет доказательств того, что рекомбинантные вирусы представляют большую угрозу для общественного здравоохранения, чем любые другие варианты. Но за рекомбинантами следует тщательно следить, чтобы мы могли понять, вызывают ли они изменения в трансмиссивности вируса, тяжести заболевания или способности избегать индуцированной вакциной иммунной защиты.
На данный момент нет необходимости чрезмерно беспокоиться о XE. Но нам необходимо продолжать наблюдение за SARS-CoV-2 в глобальном масштабе, чтобы выявлять новые варианты и понимать риски, которые они могут представлять.
Наш лучший подход к ограничению скорости появления новых рекомбинантов или других вариантов — это ограничение распространения вируса. Несмотря на широко распространенное во всем мире мнение о том, что SARS-CoV-2 будет с нами в обозримом будущем, мы по-прежнему можем применять защитные меры для замедления и подавления вируса.
К ним относятся регулярное тестирование, изоляция, когда мы заразны, ношение масок хорошего качества и улучшенная вентиляция. Все эти меры снижают шансы получить коинфекцию и стать хозяином нового рекомбинанта.
Джемма Геохеган — старший преподаватель Университета Отаго и младший научный сотрудник ESR. Она получает финансирование от Королевского общества Новой Зеландии.
Дэвид Уэлч получил финансирование от MBIE, MoH и HRC.
Джоэп де Лигт — старший научный руководитель ESR и почетный член Университета Отаго. Благодаря работе по наблюдению за геномикой в ESR Жоэп де Лигт получает финансирование от Министерства здравоохранения.
– исх. Стоит ли нам беспокоиться о варианте XE? Может быть, пока нет, но «гибриды» будут появляться чаще по мере развития COVID. https://theconversation.com/should-we-worry-about-the-xe-variant-maybe-not-yet-but-hybrids-will-become-more-frequent-as-covid-evolves-180672
ПРИМЕЧАНИЕ РЕДАКТОРА: Эта статья является переводом. Приносим свои извинения, если грамматика и/или структура предложения не идеальны.